衣原体感染的严重性因人而异，通常取决于感染部位和是否出现并发症。
衣原体感染可以引起多种疾病，不同类型的衣原体感染会导致不同的症状和后果。例如肺炎衣原体主要累及肺部，可能导致慢性支气管炎或肺气肿；沙眼衣原体则会引起结膜炎，若未及时治疗，可能导致视力损害。此外，某些人群由于免疫状态或其他基础健康状况可能对衣原体感染的抵抗力较弱，因此更容易发展成严重的感染。
在极少数情况下，衣原体感染可能会导致生殖道炎症、不孕不育等严重后果。这主要是因为衣原体可破坏精子活力，影响受孕能力。
针对衣原体感染的防治，强调早期诊断与规范治疗的重要性，并建议定期进行性健康检查以及使用安全套以降低感染风险。
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